Flora y fauna
Su flora see caracteriza porque las especies tienen de manera general una altura menor a los 15 metros y pierden casi por completo las hojas en épocas de seca, no son espinosas por lo común y poseen ordinariamente gran cantidad de bejucos. Las principales especies son entre otras: Lysiloma microphyllum, Lysiloma acapulcensis, Bursera penicillata, Bursera kerberi, Bursera grandifolia, Bursera denticulata, Bursera odorata, Bochonia spp. Trichilia colimana, Erioxylum palmeri, Piptadenia constricta, Albizia occidentalis, Albizia tomentosa, Gliricidia sepium, Senna atomaria, Senna mollis, Acacia cochliacantha, Cochlospermun vitifolium, Ceiba aesculifolia, Cordia elaeagnoides, Cordia alliodora, Cyrtocarpa procera, Heliocarpus terebenthinaceus, Plumeria mollis, Amphipterygium adstringens, Caesalpinia platlyloba y Lonchocarpus eriocarinalis. Los tipos de vegetación que existen en este estado son: Selva baja, Selva mediana o alta, Vegetación riparia, Bosque de Pino, Bosque de encino, Bosque de niebla, sabana, palmares, manglar, vegetación flotante y pastizales.
Su Fauna es, por lo tanto, principalmente de afinidad Neotropical, sin embargo, en la parte este del estado al aumentar la altitud y acercarse a la meseta del eje neovolcánico transversal, las comunidades faunísticas se ven enriquecidas por la presencia de fauna de tipo transicional, adaptada a las condiciones más templadas, y por fauna de afinidad Neártica que penetra en las regiones mas cálidas de Colima.
Clima
El clima de Colima se ve influenciado en gran manera por su relieve montañoso, el cual cubre el oeste, el norte y la parte este de la entidad. Las penetraciones de las sierras jaliscienses forman las zonas más elevadas: Cerro Gordo, sierras de Perote, El Peón y las estribaciones del volcán de Colima. La serranía de Picila limita por el sur el amplio valle de Colima, al sur, las llanuras de Tecomán terminan en un litoral bajo y arenoso. Estas sierras, por su latitud y exposición, permiten que las precipitaciones sean mayores y que el clima sea diferente en relación con las partes bajas del estado.
En la zona costera y en la cuenca del río Armería el clima es cálido y húmedo, mientras que en la parte alta es templado y cálido en la zona sur. Su temperatura promedio anual es de 28 y oscila entre una máxima de 31.5 y una mínima de 12.
Orografia
El territorio de Colima, del que casi tres cuartas partes de la superficie están cubiertas por montañas y colinas, queda comprendido dentro de una derivación de la Sierra Madre del Sur, que se compone de cuatro sistemas montañosos.
Paisaje montañoso en todo el estado, con excepción de los valles en el centro y el norte y la angosta franja costera, donde destaca la bahía de Manzanillo. La Sierra Madre del Sur en el centro y sur del estado recibe los nombres regionales de montañas del Salado al este y región montañosa occidental; los valles comprenden el de Colima, desde las faldas del volcán de Colima, con una inclinación de norte a sur, y el de Armería cruzado por el río del mismo nombre.
Hidrografia
Las cuencas hidrográficas más importantes están formadas por los ríos Cihuatlán y Coahuayana, que sirven de límite con los Estados de Jalisco y Michoacán respectivamente, y el río Armería que nace en Jalisco y recorre cerca de 294 kilómetros hasta llegar a Boca de Pascuales en el Municipio de Tecomán.
Todas las corrientes desembocan en tres cuencas que vierten sus aguas en el océano Pacífico: La de los ríos Marabasco - Minatitlán, Armería y Coahuayana - El Naranjo, este último con el río Salado como afluente.
Las lagunas de Cuyutlán, Alcuzahue y Amela, principales en el Estado, se encuentran en la zona costera en los municipios de Manzanillo, Armería y Tecomán.
En las inmediaciones del Volcán de Fuego se encuentran La María, Carrizalillo, El Jabalí y El Calabozo, consideradas como las lagunas más hermosas y con mayor atractivo turístico de la entidad.
