Flora y fauna
Flora
Flores: cempasúchil.
Árboles: pino, encino y cuachipil.
Plantas para decoración o adorno: Tepejilote, hoja de cruz.
Plantas o hierbas medicinales: epazote y ruda.
Plantas comestibles: chipil y quelite.
Frutos: piña, mamey, plátano, lima, naranja, etc.
Fauna
Aves silvestres: urraca, calandria, perico, zenzontle, tórtola.
Animales salvajes: venado, zorra, tejón, armadillo, ardilla, tlacuache.
Insectos: chapulin, abejas, avispas.
Especies acuáticas: camarón, trucha, pega piedra.
Reptiles: iguana, lagartija, culebras, víboras
Clima
Casi todos los climas del país; en lo alto de la sierra, templado con inviernos fríos; en los valles centrales y la Mixteca Alta, templado sub-húmedo y seco extremoso; en la cañada y la llanura, cálido sub-húmedo y con vientos dominantes del norte y del este.
Orografia
La montaña que atraviesa los terrenos de este municipio se forma del cerro Flores, que comienza en el río de Yogondoy y va a terminar en los confines del municipio con terrenos de los pueblos de San Francisco y San Sebastián Coatlán de la jurisdicción de Miahuatlan, tiene tres vertientes y su altura sobre el nivel del mar es de 6,000 metros.
Hidrografia
La Sierra de Oaxaca constituye el parte aguas de sus principales corrientes: Hacia la vertiente del Pacifico, el Atoyac que se convierte en el río Verde al atravesar la Sierra Madre del Sur y el Mixteco, afluente del Balsas. Hacia la vertiente del Golfo, el río Grande y el Salado que forman más adelante dos de las principales presas: la Miguel Alemán y Miguel de la Madrid, retienen las aguas de los principales afluentes del Papaloapan en el norte. De la sierra atravesada surgen los afluentes de Coatzacoalcos para desaguar en el Golfo de México y el Istmo de Tehuantepec y que desembocan en la Bahía de la Ventosa; aquí se encuentra la Presa Benito Juárez Litorales: A lo largo de 533 km playas extensas caracterizan la costa oaxaqueña, donde desembocan gran número de ríos cortos que descienden de la Sierra Madre del Sur y forman esteros y lagunas; playas naturales como Puerto Escondido, Puerto Ángel y Sacrificios, bahías como Huatulco, Santa Cruz, Tangolunda y el Gol de Tehuantepec, donde se encuentra la Laguna del Marqués, importante productora de sal.